Struktur Organisasi Kodim 0709/Kebumen sesuai Perkasad/111/XII/2012 tanggal 12 Desember 2012.

Struktur Organisasi Kodim 0709/Kebumen
22 Koramil di bawah Kodim 0709/Kebumen
- Koramil 01/Kebumen
- Koramil 02/Gombong
- Koramil 03/Sempor
- Koramil 04/Karanganyar
- Koramil 05/Karanggayam
- Koramil 06/Sruweng
- Koramil 07/Karangsambung
Pos Ramil 07 Sadang - Koramil 08/Alian
Pos Ramil 08 Poncowarno - Koramil 09/Kutowinangun
- Koramil 10/Prembun
Pos Ramil 10 Padureso - Koramil 11/Mirit
Pos Ramil 11 Bonorowo - Koramil 12/Ambal
- Koramil 13/Buluspesantren
- Koramil 14/Pejagoan
- Koramil 15/Klirong
- Koramil 16/Petanahan
- Koramil 17/Adimulyo
- Koramil 18/Puring
- Koramil 19/Kuwarasan
- Koramil 20/Buayan
- Koramil 21/Rowokele
- Koramil 22/Ayah